電磁閥和電動閥水控機兩者不同的內部結構和不同工作原理決定了它們長期運行時的性能，電磁閥和電動閥的內部結構的比較：電動閥水控機出水至關閉水的過程中，只有開和關的一剎間是通電的，所以耗電低，發熱少，而電磁閥出水至關閉水的過程中，都是通電的，因耗電多，發熱多，導致壽命短，電磁閥閥門是膠質材質的，通電后老是開開關關的，再加上受水的沖擊比較大，膠質材料不耐用，很容易老化，有些一兩年就得換。

電磁閥和電動閥水控機的原理上的比較：電動閥水控機防偷水能力強，工作原理上電動閥控水靠電機驅動球閥出水，防磁鐵吸力，電磁閥控水靠磁鐵吸力開關閥門，因此，這樣就不能很好的做到防偷水，電磁閥對水質的要求較高，要安裝過濾網，同時也要定期的清理，即使這些措施做到位，閥門也會經常不能完全關閉。

電磁閥和電動閥水控機不同內部結構和工作原理決定它們工作性能的同時，也相輔相成的決定了它們的造價，電磁閥和電動閥水控機在性價比相比較，電動閥的要高于電磁閥的。